郑登高.RESEARCH & PRACTICE

01 / RESEARCH LANDSCAPE

研究全景.

从中药关联建模出发，连接生物医学计算与科研系统。
这里记录研究成果，也保留探索和实践的位置。

01 / Learning relationships

中药关联与推荐建模

从分子关系到中药—疾病关联，再到证候引导的推荐。

02 / Connecting scales

生物医学计算与分析

通过结构、模拟与数据分析参与生物医学研究。

03 / Building research tools

科研系统与智能体

组织研究数据，连接计算工具，探索可检查的分析工作流。

iCAM-Net

从分子关系理解中药—疾病关联

将中药的成分信息与疾病相关蛋白联系起来，通过跨通道注意力与分子相互作用信号，开展可解释的中药—疾病关联预测。

  • 图学习
  • 中药—疾病关联
  • 可解释建模
已发表 · Phytomedicine 2025第一作者

SCARec

证候知识引导的中药推荐

面向症状驱动的中药推荐，将蒸馏的证候信号引入建模过程，开展模型训练、消融与分层评价。

  • 处方推荐
  • 证候知识
  • 深度学习
论文投稿中共同第一作者 · 第二位

ATP7B / Wilson disease

从蛋白结构到动态行为

参与 ATP7B 突变相关研究，通过结构准备、分子动力学模拟与轨迹分析，对照野生型和突变体的结构行为。

  • 蛋白结构
  • 分子动力学
  • Wilson disease
论文投稿中共同第一作者 · 第二位

WanYaoDB

中药专题数据与研究系统

参与成分、蛋白与靶点信息的整理和标准化，将模型预测、富集、对接与结构浏览接入中药专题研究系统。

  • 数据工程
  • 科研系统
  • 工具整合
数据与系统原型数据整理与系统开发

单细胞重分析智能体

让分析过程与证据一起被检查

探索将数据来源核对、样本设计检查、任务规划、工具执行与结果复核组织为可检查的单细胞重分析流程。

  • 单细胞重分析
  • 科研智能体
  • 证据评测
探索中工作流与评测探索

AlphaFold3 工作流

从部署到可用的结构结果

完成 AlphaFold3 部署、预测输入准备、结构及置信度结果整理与结构浏览，支持具体研究项目。

  • AlphaFold3
  • 模型部署
  • 结构预测
计算工作流实践主要承担部署与工作流

中医临床推理链

可解释临床推理的合作研究

参与中医临床推理链论文的部分实验运行、结果整理与图片设计。

  • 临床推理
  • 实验协作
  • 科研可视化
已发表 · 2026第二作者

癌症亚型分类

生物医学分类模型的合作研究

参与癌症亚型分类论文的部分实验运行、结果整理与图片设计。

  • 生物医学建模
  • 实验协作
  • 科研可视化
已发表 · 2025第二作者

结肠炎合作研究

靶点、网络与富集分析支持

围绕白及多糖与小檗碱相关研究，参与靶点整理、富集与网络分析，以及图表和论文计算材料整理。

  • 靶点整理
  • 富集分析
  • 网络分析
相关论文已发表计算分析支持

中药复方数据与机制建模

数据积累与方法探索

正在收集、整理中药复方相关数据，并研究复方机制建模方法，逐步积累数据基础与建模思路。

  • 中药复方
  • 数据整理
  • 机制建模
探索中数据收集与方法研究